Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7I2

CNPY1, Protein canopy homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY1Q3B7I2 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CNPY1Q3B7I2 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms