Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SKOR2Q2VWA4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms