Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SGSM1Q2NKQ1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SGSM1Q2NKQ1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms