Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCDC27Q2M243 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms