Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ISXQ2M1V0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms