Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IMPG1Q17R60 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms