Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
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SSX1Q16384 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SSX1Q16384 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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