Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NTRK3Q16288 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NTRK3Q16288 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NTRK3Q16288 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NTRK3Q16288 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NTRK3Q16288 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
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NTRK3Q16288 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
NTRK3Q16288 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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