Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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CDSNQ15517 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CDSNQ15517 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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