Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SF3A1Q15459 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
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SF3A1Q15459 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SF3A1Q15459 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SF3A1Q15459 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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SF3A1Q15459 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SF3A1Q15459 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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