Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SYCP1Q15431 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SYCP1Q15431 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
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SYCP1Q15431 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SYCP1Q15431 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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SYCP1Q15431 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SYCP1Q15431 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
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