Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PUM3Q15397 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PUM3Q15397 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
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