Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 FDXR-218ENST00000583881 1561 ntTSL 219.49■□□□□ 0.713e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-209ENST00000579482 2157 ntTSL 218.95■□□□□ 0.623e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.573e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.523e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-216ENST00000582710 846 ntTSL 518.04■□□□□ 0.483e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.463e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.433e-6■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 TMEM135-208ENST00000531800 201 ntTSL 53.7□□□□□ -1.821e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-214ENST00000587797 1878 ntTSL 214.86□□□□□ -0.031e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 ATP6V0A1-225ENST00000592831 4652 nt9.64□□□□□ -0.871e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-8■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 BZW1-208ENST00000452206 1059 ntTSL 512.27□□□□□ -0.454e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 BZW1-204ENST00000410110 1075 ntTSL 59.9□□□□□ -0.824e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 BZW1-212ENST00000464483 530 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.254e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 BZW1-207ENST00000450637 578 ntTSL 46.78□□□□□ -1.324e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 BZW1-210ENST00000460660 265 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.344e-7■■■■□ 22.9
PCBP2Q15366 DPH1-216ENST00000576891 537 ntTSL 410.76□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 FAM102A-201ENST00000300434 3148 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.239e-15■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 FAM102A-202ENST00000373084 3352 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.459e-15■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.489e-15■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 FAM102A-204ENST00000465821 4316 ntTSL 211.44□□□□□ -0.589e-15■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.214e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.065e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 ETV5-201ENST00000306376 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.455e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.261e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.325e-9■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 SPPL2B-204ENST00000587851 586 ntTSL 320.4■□□□□ 0.862e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.634e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 SARDH-206ENST00000427237 1957 ntTSL 217.7■□□□□ 0.424e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 SS18L1-203ENST00000450482 781 ntTSL 510.67□□□□□ -0.79e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 SS18L1-201ENST00000331758 4493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.939e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.539e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.489e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.469e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-203ENST00000396830 1776 ntTSL 1 (best)17.64■□□□□ 0.419e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.399e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.339e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-209ENST00000487279 2786 ntTSL 1 (best)15.93■□□□□ 0.149e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-208ENST00000472558 2571 ntTSL 213.55□□□□□ -0.249e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-210ENST00000488007 3001 ntTSL 513.52□□□□□ -0.259e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-207ENST00000471408 2843 ntTSL 212.82□□□□□ -0.369e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.49e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IFFO1-205ENST00000436152 3101 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.599e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.723e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.583e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.33e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 PDGFC-201ENST00000274071 2987 ntTSL 1 (best)8.55□□□□□ -1.045e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 PDGFC-203ENST00000502773 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.245e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 PKP4-204ENST00000421462 3099 ntTSL 216.11■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.95e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 CBX5-202ENST00000439541 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.863e-9■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 TEAD1-205ENST00000527575 3063 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 TEAD1-201ENST00000334310 3075 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.385e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.119e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IGF2BP2-204ENST00000457616 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.399e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IGF2BP2-201ENST00000346192 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.489e-7■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 KTN1-215ENST00000554567 730 ntTSL 524.18■■□□□ 1.461e-6■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-214ENST00000528652 519 ntTSL 317.82■□□□□ 0.442e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.152e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.012e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-208ENST00000525003 544 ntTSL 214.74□□□□□ -0.052e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.052e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.072e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-38■■■■□ 22.8
PCBP2Q15366 RAD18-206ENST00000427329 557 ntTSL 35.11□□□□□ -1.591e-10■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.091e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.241e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ANKRD17-202ENST00000358602 10784 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.463e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ANKRD17-207ENST00000558247 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.453e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.086e-9■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.926e-9■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.521e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.081e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FAM107B-212ENST00000471815 899 ntTSL 211.95□□□□□ -0.51e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FAM107B-221ENST00000487335 2317 ntTSL 1 (best)10.23□□□□□ -0.771e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FAM107B-201ENST00000181796 3785 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.121e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FAM107B-207ENST00000442012 458 ntTSL 54.19□□□□□ -1.741e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 RBPMS-219ENST00000523115 449 ntTSL 35.19□□□□□ -1.581e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 DLGAP4-211ENST00000482037 603 ntTSL 511.99□□□□□ -0.492e-10■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 DLGAP4-212ENST00000482872 839 ntTSL 511.72□□□□□ -0.532e-10■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 DLGAP4-215ENST00000495241 794 ntTSL 210.58□□□□□ -0.722e-10■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 MED15-210ENST00000432052 598 ntTSL 420.11■□□□□ 0.817e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 MED15-225ENST00000477824 571 ntTSL 519.69■□□□□ 0.747e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 MED15-215ENST00000444094 551 ntTSL 418.7■□□□□ 0.587e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 MED15-205ENST00000414658 717 ntTSL 317.61■□□□□ 0.417e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 MED15-214ENST00000441501 840 ntTSL 316.02■□□□□ 0.167e-7■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 LPCAT1-205ENST00000513757 547 ntTSL 48.96□□□□□ -0.982e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FDXR-212ENST00000580492 553 ntTSL 518.82■□□□□ 0.62e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FDXR-207ENST00000577932 572 ntTSL 218.5■□□□□ 0.552e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FDXR-210ENST00000579543 558 ntTSL 416.47■□□□□ 0.232e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 FDXR-213ENST00000581219 567 ntTSL 415.84■□□□□ 0.132e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 KIAA1671-205ENST00000494730 6082 ntTSL 1 (best)9.98□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ERI3-207ENST00000479101 367 ntTSL 312.05□□□□□ -0.484e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ERI3-208ENST00000489710 394 ntTSL 39.3□□□□□ -0.924e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 ERI3-206ENST00000462341 320 ntTSL 34.99□□□□□ -1.614e-6■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.275e-12■■■■□ 22.7
PCBP2Q15366 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -05e-12■■■■□ 22.7
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