Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms