Protein–RNA interactions for Protein: Q15075

EEA1, Early endosome antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEA1Q15075 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
EEA1Q15075 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms