Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
NR1D2Q14995 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
NR1D2Q14995 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms