Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CKAP5Q14008 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CKAP5Q14008 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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