Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SPTAN1Q13813 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SPTAN1Q13813 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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