Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHROOM2Q13796 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SHROOM2Q13796 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
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SHROOM2Q13796 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
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SHROOM2Q13796 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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SHROOM2Q13796 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
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SHROOM2Q13796 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
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SHROOM2Q13796 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
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SHROOM2Q13796 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SHROOM2Q13796 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
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