Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
ATP1A4Q13733 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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