Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
BFSP2Q13515 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
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