Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PMS2P3Q13401 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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