Protein–RNA interactions for Protein: Q13131

PRKAA1, 5'-AMP-activated protein kinase catalytic subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAA1Q13131 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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PRKAA1Q13131 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PRKAA1Q13131 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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