Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRDM2Q13029 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PRDM2Q13029 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms