Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
FOXF1Q12946 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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