Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
NFIAQ12857 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
NFIAQ12857 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
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