Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CGNL1Q0VF96 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CGNL1Q0VF96 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms