Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IFFO1Q0D2I5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms