Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GOLGA3Q08378 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GOLGA3Q08378 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms