Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CXCL9Q07325 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CXCL9Q07325 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms