Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EXOSC9Q06265 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms