Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ATP7AQ04656 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ATP7AQ04656 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms