Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RELAQ04206 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RELAQ04206 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RELAQ04206 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RELAQ04206 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RELAQ04206 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RELAQ04206 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms