Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF85Q03923 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms