Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CDK16Q00536 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms