Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
GTF2BQ00403 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
GTF2BQ00403 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.2 ms