Protein–RNA interactions for Protein: P78552

IL13RA1, Interleukin-13 receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1P78552 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
IL13RA1P78552 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
IL13RA1P78552 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
IL13RA1P78552 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
IL13RA1P78552 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms