Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CSNK2BP67870 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CSNK2BP67870 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms