Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 BX547991.1-201ENST00000582543 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PSMA6P60900 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms