Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CABP4P57796 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CABP4P57796 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CABP4P57796 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms