Protein–RNA interactions for Protein: P56750

CLDN17, Claudin-17, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN17P56750 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CLDN17P56750 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLDN17P56750 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms