Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CAV3P56539 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CAV3P56539 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms