Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
RAD23AP54725 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAD23AP54725 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms