Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNB3P54284 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms