Protein–RNA interactions for Protein: P49458

SRP9, Signal recognition particle 9 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP9P49458 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SRP9P49458 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SRP9P49458 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms