Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ARL1P40616 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ARL1P40616 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms