Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GGCXP38435 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GGCXP38435 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms