Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDRP35968 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDRP35968 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KDRP35968 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDRP35968 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDRP35968 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KDRP35968 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KDRP35968 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KDRP35968 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KDRP35968 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KDRP35968 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KDRP35968 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms