Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CTNNB1P35222 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CTNNB1P35222 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms