Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
HOXA11P31270 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
HOXA11P31270 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms